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首先，兩個藥的是不同的藥，處方和適應癥也不同。
云南白藥是由云南民間醫生曲煥章吸取民間傳統配方,經過多年鉆研和實踐而首創配制的,最初取名為“百寶丹”,后稱云南白藥。現由云南白藥集團生產。處方是國家級保密處方，主成分為三七。
云南紅藥原名云南七龍散，和云南白藥有一定歷史淵源，都是云南科技工作者的心血結晶。不過它的處方和白藥是不同的。療效作用也是有所不同的。而且也是有國字準號的正規藥品，其標準收載于部版標準。云南紅藥的功效是消腫止痛，活血化淤，舒筋活絡，祛風除濕，用于胃潰瘍出血，支氣管擴張咯血，功能性子宮出血，月經過多，眼底出血，眼結膜出血，鼻衄，痔瘡出血，軟組織挫傷，風濕性關節炎，風濕性腰腿痛等。
另外，兩個藥的顏色也是不同的，白藥是有點帶黃色的，紅藥是棕紅色的。患者應注意辨別！
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