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8月26日,巴塞羅那大學(xué)遺傳學(xué)教授ManelEsteller在《TheLancetOncology》雜志中展示了一種新發(fā)明的表觀遺傳學(xué)檢測技術(shù)——EPICUP,這種技術(shù)可以診斷腫瘤的起源,使醫(yī)生能夠根據(jù)腫瘤類型來制定更具體的治療方案。
對于癌癥患者,初級診斷往往包括檢測原發(fā)腫瘤以及是否會發(fā)生轉(zhuǎn)移。然而,5%-10%的人類腫瘤的診斷結(jié)果與之相反,即往往先診斷出轉(zhuǎn)移的腫瘤,使用各種診斷測試后仍無法檢測到原發(fā)灶,這種情況也被稱為未知原發(fā)灶腫瘤(CUP)。由于腫瘤類型不為人所知,這些患者的生存率非常有限。
ManelEsteller教授是ICREA研究員、Bellvitge生物醫(yī)學(xué)研究所(IDIBELL)表觀遺傳學(xué)與癌癥生物工程(PEBC)主管,他說,“幾年前,我們開始認(rèn)識到,調(diào)節(jié)基因活性的化學(xué)模式(表觀遺傳學(xué))因組織而異,例如它們在胰腺細(xì)胞和肺細(xì)胞中各有不同。我們已經(jīng)通過一萬多個人類腫瘤樣本分析了每種癌癥的表觀遺傳學(xué)特征。如今在研究原發(fā)灶未知的轉(zhuǎn)移腫瘤的DNA時,我們可以通過所獲取的表觀基因圖像來判斷它屬于哪個家族,如屬于胰腺癌、結(jié)直腸癌、肺癌或者是乳腺癌等,換句話說,通過這種方法我們可以診斷腫瘤的起源。”
通過表觀遺傳學(xué)檢測來確定癌癥的類型,將對治療有顯著的影響。“從現(xiàn)在開始,患者將不用接受盲目的治療,因為我們能夠為不同類型的腫瘤提供更具體的治療方案;事實上,我們的初步數(shù)據(jù)顯示,這種方法使患者生存率翻了一番。”Esteller教授說,“需要記住的是,這不是未開發(fā)的領(lǐng)域,如今我們已經(jīng)與Ferrer實驗室合作使這種方法的推廣和應(yīng)用成為了可能。”
那么,EPICUP到底是個怎樣的技術(shù)?
研究人員建立了基于微陣列DNA甲基化標(biāo)簽(microarrayDNAmethylationsignatures)的癌癥分類方法,并將之稱為EPICUP。數(shù)據(jù)源于2790個起源已知的腫瘤樣本,這些樣本代表了38類腫瘤,包括85個轉(zhuǎn)移病例。
為了驗證這種癌癥分類方法,研究人員使用了另外一組包含7691個腫瘤的樣本,這些腫瘤的來源與上述樣本相同,包含了534個轉(zhuǎn)移病例。研究人員利用自己開發(fā)的診斷方法來預(yù)測216個起源未知但特征明顯的腫瘤的類型,并在尸體解剖檢查、光鏡、綜合免疫組化分析之后對原發(fā)部位進(jìn)行數(shù)月臨床檢測,從而對EPICUP方法預(yù)測腫瘤類型的準(zhǔn)確度進(jìn)行驗證。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),在包含7691個腫瘤樣本的試驗組中,基于DNA甲基化的腫瘤分類方法表現(xiàn)出的特異性、敏感性、陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值分別為 99.6%、97.7%、88.6%和99.9%。對于216個起源未知的腫瘤,DNA甲基化分析能夠預(yù)測出了87%的起源。與接受經(jīng)驗性治療方法的患者相比,EPICUP診斷后接受特異性治療的患者總生存率有改善。
研究人員解釋,發(fā)展基于DNA甲基化的診斷方法可顯著提高未知原發(fā)灶腫瘤的診斷效率,并能更精確地指導(dǎo)治療。表觀遺傳學(xué)分析可揭露未知原發(fā)灶患者的原發(fā)性腫瘤部位,對癌癥患者的臨床管理有進(jìn)一步改善。