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與其它肝素類制劑相同，不同部位的出血表現，多發生于有其他危險因素的病人(參照禁忌癥和藥物相互作用)。偶有血小板減少癥、偶有血栓形成報道(參照特別警告)肝素和低分子量肝素治療時，極少數患者出現皮膚壞死，一般發生在注射部位，其先兆表現為紫癜、浸潤或疼痛性紅斑，有或沒有臨床癥狀。如出現皮膚壞死應立即停藥。
偶有注射部位小血腫，偶有堅硬的小結出現，但不表示肝素的包囊形成，這些小結通常幾天后消失。皮膚反應停藥后可恢復的嗜曙紅細胞增多全身性過敏反應，包括血管神經性水腫一過性轉氨酶增高極個別病例有陰莖異常勃起和與肝素誘導。
因可能增加出血的危險性，不主張與阿斯匹林(或其他水楊酸類藥物)或非甾體抗炎藥和其他抗血小板藥物聯合應用。如必須聯合用藥，應進行密切的臨床和生物學監測。口服抗凝藥、糖皮質類固醇和右旋糖酐的病人，慎用硫酸氨基葡聚糖鈣鈣。對已應用硫酸氨基葡聚糖鈣鈣的病人應用口服抗凝劑，硫酸氨基葡聚糖鈣鈣的治療應持續到INR穩定。不相容性：不能與其它制劑混合。
硫酸氨基葡聚糖鈣鈣具有明顯的抗凝血因子Xa活性，抗凝血因子Ⅱa或抗凝血酶的活性較低(30IU/ml)。藥效學研究表明硫酸氨基葡聚糖鈣鈣可抑制體內、外血栓和動靜脈血栓的形成，但不影響血小板聚集和纖維蛋白原與血小板的結合。在發揮抗栓作用時，出血的可能性較小。針對不同適應癥的推薦劑量，硫酸氨基葡聚糖鈣不延長出血時間。在預防劑量，它不顯著改變APTT。本品小白鼠皮下注射和尾靜脈注射給藥的LD50值分別為3764mg/kg、1655mg/kg。
對本品過敏者：有硫酸氨基葡聚糖鈣鈣引起的血小板減少癥病史與凝血障礙有關的出血征象或出血危險性，非肝素誘導的彌漫性血管內凝血除外容易出血的器質性病變腦血管出血性意外急性細菌性心內膜炎。
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